明清时期，水上交通依然占据主导地位，漕运是交通运输物资流通经济往的主要形式，当时家管理漕运的最高机构漕运总督署就设在如今的淮安区，漕运博物馆便是在其遗址上建立的。
博物馆外观为明清时期建筑风格，造型简单的牌楼雕砌的栏杆红墙褐瓦尽显古朴典雅。整个展馆为两层，分序厅漕运渊源厅漕运咽喉厅以及千年载运厅，用丰富的藏品和高科技手段向人们介绍了运河和漕运相关的知识。 实景还原如同一件巨大而精美的作品，将漕运的忙碌繁华景象描绘得惟妙惟肖。 千年漕运，运输过关系计民生的粮食作物，也运输过满足人们精神生活的丝绸茶叶瓷器等物品。如今在运河沿岸的考古过程发现了以陶瓷为主的诸多古物，它们曾经深埋于河泥之下，是千年漕运最坚定的见证者。 制造漕船的过程在展馆得以还原，栩栩如生。 在古时，漕运对城市和家经济的发展无疑是至关重要的。漕运带巨大的人口流动和商品流动，丰富了沿河地区城市的市场，为当地的商业发展带了最基础的商品物资，成就了这些沿河城市的繁华富庶，淮安也是其一。 许多实景还原的景物让人叹为观止，按比例缩复原制作的漕舫精美华丽，古代工匠的无限智慧和精巧手艺在千百年后依然让后人折服。 馆内资料相当丰富，还展陈有五万余件文物，其的镇馆之宝元青花更是值得细细观赏的宝级文物。 每一件藏品，每一幅图画都无言叙述着漕运曾有的辉煌和不凡的过往。打卡有运河之都之称的淮安，这座历史感满满的漕运博物馆一定要转一转。